Dr. Didem Ökmen, Dokuz Eylül Üniversitesi, İzmir Uluslararası Biyotıp ve Genom Enstitüsü (iBG-İzmir) bünyesinde, Moleküler Biyoloji ve Genetik alanında 2018–2025 yılları arasında yürüttüğü doktora çalışmalarına YÖK 100/2000 Doktora Projesi bursiyeri olarak başlamış, doktora tez çalışması TÜBİTAK BİDEB 2211-C Yurt İçi Öncelikli Alanlar Doktora Burs Programı ile desteklenmiştir. Doktora tezini “Transkriptomik Veriler Kullanılarak COVID-19 için Yeni Tanısal ve Terapötik Biyobelirteçlerin Belirlenmesinde Makine Öğrenmesi Uygulamaları” başlığıyla tamamlamıştır. Doktora sürecinde hesaplamalı sistem biyolojisi yaklaşımıyla, büyük ölçekli transkriptomik verilerde ileri düzey biyoinformatik analizler ve makine öğrenmesi temelli biyobelirteç keşfi, özellik seçimi ve prediktif model geliştirme konularında uzmanlaşmıştır.
Bu süreçte kanser biyoinformatiği ve meta analiz odaklı çalışmalara da katkı sağlamış, Cancers dergisinde yayımlanan HOTAIR temelli meta ve biyoinformatik analiz çalışması dâhil olmak üzere hakemli yayınlar üretmiştir.
Akademik arka planını iki güçlü eksende birleştirmektedir, istatistik alanında lisans ve yüksek lisans eğitimi ile analitik modelleme yetkinliği, bilgisayar programcılığı eğitimi ve kurumsal IT deneyimi ile yazılım ve veri altyapısı tecrübesi. Çalışmalarında R ve Python, Linux tabanlı HPC ortamları, nf-core/Nextflow iş akışları ve yeniden üretilebilir biyoinformatik boru hatları kullanmaktadir
DemircanLab’da, TÜBİTAK BİDEB 2218 Yurt İçi Doktora Sonrası Araştırma Burs Programı desteği kapsamında “Model Organizmalarda Multi-Omik ve Biyoinformatik Analizi: Döngüsel RNA’ların Düzenleyici Rolü ve İlaç Yeniden Konumlandırma” projesinde yürütücü olarak görev almakta, laboratuvarın kanser ve rejeneratif tıp odağında daha etkili terapötik stratejilere katkı üretme hedefiyle uyumlu biçimde, çoklu-omik veri entegrasyonu, circRNA’ların düzenleyici rolleri ve rejeneratif model organizmalarda hesaplamalı analizler üzerine yoğunlaşmaktadır/ Akademik çalışmalarının yanı sıra, Türkiye Bocce Bowling ve Dart Federasyonu (TBBDF) kapsamında Türkiye üçüncülüğü dâhil çeşitli derecelere sahiptir ve 2023 Bodrum Kadınlar Dart Şampiyonu olmuştur
DemircanLab 